׳¦׳׳˜

הידעת? הדפדפן שהינך גולש ממנו אינו עדכני

הדפדפן שהינך גולש ממנו אינו עדכני ויתכן שהאתר אינו יעבוד בצורה טובה. הדפדפנים הנתמכים באתר הם:

לחץ על האיקונים למעבר לדף ההורדה של הדפדפן

סגירת חלונית אל תציג בשנית

בסגירת החלונית תועבר/י לאתר מותאם לדפדפן ויתכן כי חלק מהאתר לא יעבוד בצורה מיטבית

gnmalign

הדפסה דוא

 

A program to compare proteins' dynamics by aligning GNM slow modes

gnm modes calculation:

 

GNM Web Server by Ivet Bahar's group

GNM Stand alone program by Ivet Bahar's group

 

Another GNM stand alone program used in this tutotial (written by us)

compilation:

tar -xvzf gnmcpp1.tar.gz

cd gnmcpp1

g++ -O2 gnm.cpp -o gnm

 

GNM Pairwise Alignment software

gnmalign stand alone program

compilation:

tar -xvzf galign.tar.gz

cd galign

make

 

Tutorials

GNM align Tutorial

Input files

 

References

  1. D.Tobi; Dynamics alignment: Comparison of protein dynamics in the SCOP database, Proteins 80(4):1167-76 (2012)
  2. D.Tobi; Large Scale Analysis of the Dynamics of Enzymes, Proteins 81(11):1910-8 (2013)
עדכון אחרון ב-שני, 22 יוני 2015 14:11
 

 

ברוכים הבאים לאתר אוניברסיטת אריאל בשומרון לכל צורכי הנגישות יש ללחוץ על כפתור הנגישות למעלה